Tragerea la sorți a șaisprezecimilor de finală, fază în care în competiție intră și echipele din Liga 1, va avea loc joi, 12 septembrie, de la ora 12:00, la Casa Fotbalului, sala „Nicolae Dobrin”.
Universitatea Craiova este in urna capilor de serie, iar adversarul cel mai periculos pe care ar putea sa il intalneasca este FC Botosani. Totodata, Stiinta poate da si peste cealalta echipa a orasului, FCU Craiova ajungand si ea in aceasta faza a competitiei.
Partidele din saisprezecimi vor avea loc in perioada 26-29 septembrie, iar Craiova va evolua in deplasare indiferent de numele adversarului.
| URNA A | URNA B |
| FC CFR 1907 Cluj SA | AFC Botoşani |
| SC Fotbal Club FCSB SA | CS Concordia Chiajna |
| SC FC Viitorul Constanţa SA | AFC Chindia Târgovişte |
| Universitatea Craiova | Academica Clinceni |
| AFC Astra | FC Petrolul Ploieşti |
| ACS Sepsi OSK Sfântu Gheorghe | FC Metaloglobus Bucureşti |
| CS Gaz Metan Mediaş | AFC Ripensia Timişoara |
| SC Dinamo 1948 SA | AFC UTA Arad |
| SC FC Voluntari SA | Fotbal Club Rapid |
| ACSM Politehnica Iaşi | CSM Reşiţa |
| AFC Hermannstadt | U Craiova 1948 SA |
| AS FC Universitatea Cluj | ACS Flacăra Horezu |
| CS Mioveni | ACS Foresta Suceava |
| AFK Csikszereda Miercurea Ciuc | Sănătatea Servicii Publice Cluj |
| AFC Turris-Oltul Turnu Măgurele | AFC Metalul Buzău |
| CS Făurei | |
| ACS Industria Galda |